Sequencing - sequencing yog ... Sanger

Nws yog lub npe hu hais tias tus tib neeg genome muaj plaub "cov tsiaj ntawv". Lawv conventionally xa mus rau raws li A, C, G thiab T. Nyob rau hauv lwm yam lus, cov neeg genome yog kiag li ua los ntawm plaub hom molecules - adenine, cytosine, guanine thiab thymine. Ib tug loj pes tsawg tus chromosomes nyob rau hauv lub noob yog tsis muaj pov thawj ntawm kuj zoo kawg txoj kev loj hlob. Nws hais tias tsuas hais txog cov xov tooj ntawm ntshai heev txawm thiab shocks, los ntawm kev uas muaj kev tswj kom tau mus rau ib tug kev lom hom. Yuav ua li cas cov ntaub ntawv no muaj nyob rau hauv lub DNA, thiab los ntawm dab tsi txoj kev nws ua tau decipher tus txheem ntawm tus tib neeg genome?

Aims ntawm kev tshuaj ntsuam genetic

Tag nrho cov genome sequencing tso cai rau koj mus nyeem tag nrho cov ntawm ib theem zuj zus ntawm cov "cov tsiaj ntawv". Nws tso cai rau koj kom paub tias tsis paub hais tias cov noob thiab ua kev kho mob kho raws li zoo li sai tau. Uas yog vim li cas ib qho ntawm feem nrov kho mob (ntawm chav kawm, cov neeg uas muaj peev xwm them taus nws) yog sequencing. Mob ntshav qab zib, mob cancer thiab kab mob plawv - ib tug predisposition mus rau cov kab mob ua rau nws tau qhia hais tias yuav DNA seev suab txheej txheem. Raws li cov kev forecasts, tus neeg muaj lub peev xwm yuav tau kho koj txoj kev ua neej los txo cov kev phiv tej yam. Yog li ntawd, ib co kev soj ntsuam ntseeg tau hais tias tag nrho cov genome sequencing yuav tsum tau muaj nyob rau hauv ib tug txheej ntawm yuav tsum tau neonatal kev tshawb fawb.

Keeb kwm ntawm lub project

genome seev suab project twb launched nyob rau hauv thaum ntxov 90s. Nyob rau hauv thiaj li yuav ua kom tiav cov genome tshwm sim, nws coj txog ib tug ib nrab teb xyoo. Qhov no kev tshawb fawb project coj tuaj ua ke nyob ib ncig ntawm nws tus kheej tshawb fawb los ntawm ntau lub teb chaws - Tuam Tshoj, lub teb chaws Yelemees, Fabkis thiab Nyiv. Thaum pib ntawm lub tshiab Millennium, Bill Clinton thiab Toni Bler officially tshaj tawm hais tias lub "cua ntsawj ntshab" ntawm lub genome tiav. Nyob rau hauv 2006, Xwm Publishing tau luam tawm cov ntaub ntawv uas twb tau kawg ib theem zuj zus ntawm lub chromosome. Tsis tas li ntawd nyob rau hauv kev ua lag luam muaj ib tug kev tshuaj ntsuam genetic kev pab exome sequencing - tus txheej txheem ntawm kev txheeb xyuas cov puas chaw nyob rau hauv lub DNA molecule. Lub tuam txhab considers uas muaj nyob rau hauv lub chaw pib ntawm ib tug tshiab era.

Yuav ua li cas yog lub sequencing?

Sequencing - qhov no yog qhov theem kawg ntawm tus tsom xam ntawm tus tib neeg genome. Ua ntej cov kauj ruam raws li: cov ntaub ntawv uas xaiv thiab cloned. Thiab kuj tshwm sim pretested DNA cheeb tsam yooj yim txoj kev. Sequencing - ib tug txiav txim zaum kawg ntawm lub nucleotide series ntawm cov DNA molecule. Nyob rau hauv tag nrho muaj ob txoj kev ntawm kev tshuaj ntsuam genetic: thawj, siv cov qauv ntawm cov Maxam-Gilbert. Nws yog raws li nyob rau hauv DNA cleavage txoj kev ib puag. Muaj yog ib qho yooj yim txoj kev, uas nyob rau hauv kev xyaum no yog siv ntau tshaj. Qhov no thiaj li hu ua dideoxy txoj kev, los yog Sanger sequencing.

Theem seev suab lub genome Sanger

Cov yav tas txoj kev muaj raws li nram no theem ntawm txoj kev tshawb:

• kawm fragment ntawm cov DNA molecule hybridizes nrog primer;
• Nws tshwm sim enzymatic synthesis ntawm cov molecule;
• nyob rau hauv lub kauj ruam tom ntej cov ntaub ntawv uas yog raug rau electrophoresis;
• thiab thaum kawg, cov kev tshwm sim yog analyzed los ntawm kev soj ntsuam, geneticists nyob rau autoradiograph.

Feem ntau ntawm cov pab kiag li lawm yuav paub txog mus txog rau 300 bands nyob rau hauv lub DNA molecule.

Tus txheej txheem ntawm decryption DNA Sanger

Tus thawj txoj kev ntawm sequencing uas zaum yuav siv tau los ua lub genome, twb sequenced los ntawm Sanger (Sanger sequencing). Nws essence muaj nyob rau hauv cov nram no: Cov DNA yog cloned, thiab ces tus uas ua sib tov twb muab faib ua plaub qhov chaw. Txhua yam ntawm lawv yog muab tso rau hauv ib tug tshwj xeeb tshuaj, uas muaj cov nram qab no cov khoom xyaw:

• molecule DNA polymerase;
• primers uas pab txhawb replication txheej txheem;
• ib tug sib tov ntawm cov plaub nucleotides ntawm cov ntawv luam;
• ib tug neeg variations thereof nucleotides.

Yog li, lub genome Sanger zoo tib yam rau tib neeg DNA cloning txheej txheem. Cov dab txawv xwb nyob rau hauv uas mixed rau hauv qhov cuav yam nyob rau hauv lub nucleotides.

Decryption txheej txheem hnub no

Tam sim no cov qauv ntawm cov Sanger sequencing yog kiag li caw kaw lus. Nws yog nqa tawm siv tshwj xeeb khoom - cov cav tov yog hu ua sequencer. Tshuaj lom neeg tshua muab qhov chaw nyob rau hauv ib lub raj. Cov kev tshwm sim tau los ntawm qhov cim Sanger analyzed siv computer technology. Niaj hnub nimno sequencers yuav "nyeem" cov ntaub ntawv mus rau lub 600-1000 nucleotides ib txhij. Los ntawm automating lub sequencing yog tshwm sim sai npaum li cas tshaj ua ntej.

Nws yuav tsum muaj nyob rau?

Tam sim no cov uas lub teb chaws uas tsim DNA sequencing, yog Tuam Tshoj thiab lub teb chaws As Mes Lis Kas. Lawv yog cov nyob rau hauv ib qhov teeb meem ntawm kev sib tw - yeej ib lub teb chaws uas muaj peev xwm rau decrypt thawj tib neeg genome, kev siv nyiaj yog tsawg tshaj li ib puas duas las. American kev tshawb fawb lub tuam txhab hu ua Ilumina - Tuam Tshoj lub ntsiab yeeb ncuab nyob rau hauv cov teeb meem no. Suav zaum nyob rau hauv 2010 tau muas first-class cov khoom, uas tso cai rau lawv mus nyob rau tag nrho cov xyoo ib tug ua txoj hauj lwm nyob rau hauv kev ua lag luam rau genome sequencing cov kev pab cuam. Tab sis, thawj, cov pab kiag li lawm yuav inevitably ua obsolete, thiab, ob, cov kev pab cuam rau seev suab lub DNA yog ua ntau thiab ntau pheej yig. Tam sim no Tuam Tshoj tsis xav kom siv lub twb ploj lawm nyiaj rau cov khoom los ntawm txawv teb chaws - tus zaum txiav txim siab los tsim nws tus kheej kev kho vajtse. Leej twg yuav yeej tus sib ntaus sib tua rau cov hlau lead - lub sij hawm yuav qhia rau. Tab sis niaj hnub no genome seev suab nyob rau hauv tej rooj plaub nqi tsawg tshaj $ 600.

Yog noob ntawv tseem ceeb yuav pab tau?

Txawm li cas los, tsis yog txhua yam li tej yam yooj yim nyob rau hauv cov teeb meem no. Ib txhia soj ntsuam hais tias noob sequencing tsis coj ntau pab, ntau npaum li cas tsim txom. Tau tus txheej txheem no yog tiag tiag ib yam dab tsi yuav tsum tau ib tus tib neeg los yog ib tug pab rau science? Yog vim li cas ib txhia kws muaj feem xyuam rau deciphering lub DNA ntawm ntau tshaj ib qho tseem ceeb?

Lub fact tias cov sequencing hom kev kawm, nyob rau hauv lawv pom, yog tsis muaj dab tsi ntau tshaj li ib tug super-niaj hnub txoj kev fwv yees. Lub luag hauj lwm rau muab cov lus qhia txog lawv cov genome ib tug neeg yog nws tus kheej. Txawv motives yog thawb neeg teb cov lus nug txog lawv cov DNA. Ib tug neeg nrhiav li paub lawv tus kheej zoo dua. Ib tug neeg yog sim los tiv thaiv lawv tus kheej los ntawm tus kab mob - thiab yog koj ua txhua yam rau muaj kev ruaj ntseg. Txawm li cas los, qhov no mus kom ze yuav tsis tshua muaj tsis zoo.

Piv txwv li, cov neeg uas paub tias lawv muaj ib tug uas yuav tsim Oncology nyob rau hauv lub neej yav tom ntej pib txom nyem los ntawm kev nyuaj siab thiab tsis muaj kawg khiav ib ncig ntawm rau cov kws kho mob. Thiab qhov no txawm lub fact tias txawm lub teb sequencing loo tau hais tias kwv yees txoj kev loj hlob ntawm qhov txaus ntshai kab mob nrog ib tug uas yuav ntawm 50%. Qhia, txawm li cas los, extends ib tug yoj ntawm hysteria ntawm cov neeg muas zaub ntawm cov kev pab cuam. Tag nrho cov no tau coj mus rau lub fact tias ib txhia cov tub ceev xwm, xws li lub tebchaws United States, tiag undertook kom tsis txhob muaj kev ua ub no ntawm kev kho mob tuam txhab uas muag.

Cov kev tshuaj ntsuam genetic passport - yog los yog tsis muaj?

Nyob rau hauv lub domestic ib puag ncig yog ib qho kev nce nrov qhia "caj passport". Tab sis, raws li yog feem ntau rooj plaub, science yuav tsis puas yuav to taub tag nrho lub txim ntawm lawv cov achievements. Tom qab seev suab ntawm "cov tsiaj ntawv" tseem tsis guarantee hais tias yuav tsum to taub kom sau ntawv "lo lus." Piv txwv li, noob caj noob ces tseem tsis tau kom meej meej teb rau lo lus nug ntawm yuav ua li cas muaj ntau yam noob muaj nyob rau hauv tus tib neeg lub genome. Yav tas los nws twb ntseeg tau tias tus nqi no yog hom twg los ntawm 10 txhiab rau 40 txhiab. Tam sim no, soj ntsuam tau muab tso rau pem hauv ntej lub assumption tias qhov no tus xov tooj yog nyob rau hauv lub chav 10 - 25 txhiab. Ntau precisely nws yog tsis yooj yim sua. THIAB sequencing ntawm lub genome yog cia li ib tug piv txwv ntawm yuav ua li cas tshawb ua ib tug ua ntawm ntau txawm tias unanswered cov lus nug.

Tus nqi ntawm cov genome sequencing yog tam sim no qhov kev txiav txim ntawm 1 txhiab. Las. Txawm li cas los, cov kev nyeem ntawv ntawm cov noob rau ntau yog ib lub xwb qhov uas ntxiv kev nyuaj siab. Rau cov nyiaj cov neeg muas zaub tau xws tau, los ntawm uas ces yuav pw tsis tsaug zog thaum hmo ntuj. Sequencing - txoj kev tshawb no, uas muaj cov ntaub ntawv nyob rau txawv noob. Xws li "kev tshuaj ntsuam genetic passport" xws li muaj noob uas muab kev koom tes nyob rau hauv txoj kev loj hlob ntawm ntau yam kab mob - mob ntshav qab zib, rog, kab mob plawv. Tsis xav yuav ib tug geneticist ntawm thoob ntiaj teb cov hoob kawm to taub hais tias cov kab mob tej zaum yuav caj tom qab, Txawm li cas los, thiab ib txoj kev ntawm lub neej uas ua rau yus ib tug neeg mus ua si ib tug tseem ceeb luag hauj lwm.

tau uas tsis

Tam sim no, muaj ntau zaum taw tes rau lub fact tias nyob rau hauv tus txheej txheem ntawm sequencing yog feem ntau tsis yooj yim sua kom tsis txhob yuam kev. Ntxiv mus, lawv yuav tshwm yog tsis ntsuas los ntawm kaum thiab tag nrho feem pua. Lawv cov keeb kwm yog kev cob cog rua nrog nta decryption technology. Sequencing - ib tug txheej txheem uas yuav muab piv rau ua cov ntawv luam ntawm cov loj loj movie ntev li ntawm ob peb txhiab ntas. Nyob rau tib lub sij hawm tso cai rau ua cov ntawv luam ntawm uas nws yuav tsum tsis pub ntev tshaj 20 ntas. Hais tias lawv yog raws li muaj tseeb li sai tau, lawv raug muab tshem tawm "nrog cia" ntxiv feem sib tshooj txhua lwm yam. Nrog rau seev suab ntawm tus tib neeg genome yog tseem nyuaj - vim yog tib neeg chromosome ntev yog kaum thiab pua pua ntawm billions ntawm cov tsiaj ntawv. Ua hauj lwm yog mus sau cov tib neeg genome yog heev ambitious rau ntau lub teb chaws. Tam sim no, txawm li cas los, lub xaus yuav tsuas yog ua ib tug - noob yog tau koom ua ke los ntawm ib tug loj tus naj npawb ntawm uas tsis. Tej zaum nyob rau hauv lub neej yav tom ntej, zaum yuav tau mus ntes cov ntaub ntawv ntau yog. Thiab tam sim no peb yuav tsum tau muab tso rau mus nrog qhov teeb meem no.